组织机构代码纸质档案扫描是近年来全国组织机构代码管理中心布置的一项重要工作，也是代码事业发展的必然要求。南京市标准化研究院代码管理中心早在2001年就已开展电子档案扫描工作。为进一步保证代码数据质量，强化组织机构代码档案的管理，市代码中心于08年上半年对有关区县分局代码管理机构全面启动了代码电子档案扫描的工作，专门制订了《南京市组织机构代码电子档案工作实施细则》，下发至各区县分局代码管理机构。
    中心要求各区县分局大力组织人力、物力，克服种种困难，力求将沉积的历史档案全部扫描成电子文件。经过几个月的不懈努力，成效显著，已完成历史档案扫描11700份，预计今年上半年可圆满完成历史档案扫描任务。自下半年起，要求响应国家代码中心的号召，实现代码数据同步电子化的目标。
    在完成这项工作的过程中，中心通过不断总结经验、探索新方法，使扫描效率由最初每人每天完成200份提高到400多份，大大提高了工作效率，已达到当天产生的档案第二天便扫描成电子文档，基本实现了代码数据同步电子化的目标。为促进代码电子档案扫描工作的全面开展,全方位达到国家代码中心的要求，中心专门组织人员对扫描完成的电子档案和经整理归档的纸质档案进行定期抽查，要求进一步完善电子档案数据库，实现电子档案数据库与代码信息共享平台的对接。